神组织的强大超出了想象，忍者世界开始跳出一些人，来作为位对抗这些人的力量。如果单单靠着一个国家来对抗神组织这庞然大物的话，不论是哪一个国家都会被拖垮，即便是强大如木叶的存在，他们也不可能分出一份力量去对抗强大的神组织。
忍者世界彻底的脱离了原来的走向，脱离了历史的时代变更。二战彻底结束，三战开启，但这次战争却是针对神组织的战争。
各村忍者都排出忍者，去搜寻这个癫狂的自命清高的神组织。神组织的成员，则也是感受到了忍者世界传来的敌意，于是开始针对各大国发起了各种恐怖袭击。
忍者村子或许能抵挡的住这种袭击，但一个国家可不只是有一个忍者村子建立起来的，神组织向着那些弱小的区域发起袭击。甚至是发起了几次屠村事件，五大国中，都感受到了这种压力。
各村的影，也是再次加强了对狩组织力量，都派出了一部分优秀的上忍进入到那股组织中，即便是不能对神组织的人造成伤害，但却可以大大的限制神组织的活动力度。
更有忍者研究出来一种针对神组织的捕猎的行动，神组织的人，掌握着一种神奇的空间之力，可以在一定的空间内瞬间移动，这也就是他们为什么一直都能在作恶之后，迅速逃离的手段。而有忍者提出了封印空间术的手段，制造出了一大片封印空间，途中差点将火神给抓捕成功。可惜的是，神组织的另外成员杀来，将火神救走。
神组织不止是火水土雷风五个神，在这五个人之下，似乎还有一些为神组织服务的忍者们。实力虽然不能达到五个神使的强大，但绝对是精英上忍级别的存在，更是有着自己的想法，对神组织的狩猎行动中，这些神组织的忍者们，也给狩组织造成了非常大的麻烦。
羽田宁在这些个日子里一直都是作为一个幕后者，站在幕后，再也没有真正的站在前面去做什么事情了。
两年的时间，从刚开始，将家般到了一个靠近，火影大楼的位置之后，便是离开了木叶忍者村，去到了死亡森林之中，去进行训练。
因为一直都很关注羽田宁的伤势，所以在那段时间，经常会来看望羽田宁，而羽田宁当然知道自己离开村子的事情，是不可能瞒过纲手的，于是也就直接和盘托出。
纲手选择影藏他的秘密，其实她也是一个非常讨厌战争的忍者，如果可以的话，她也不想继续去参与进这场忍者世界的大战之中。同样，她也是有着自己的目的的，她想要研究羽田宁的身体，因为羽田宁身上的伤，好的实在是太快了，不得不让她想起自己的祖父，千手一族的力量，才会让一个忍者身体恢复的迅速。
只是羽田宁的身上的恢复的速度，比起千手一族又似乎慢了一些，千手一族中，如果真的是觉醒了千手一族的血脉的话，那种恢复速度不是一般的快的，当然这种恢复也会给身体留下后遗症。历史上，也只有少数人，才能真正的克服这种后遗症。而羽田宁的情况，和千手一族的血脉，类似又不完全一样，他的伤恢复的非常的彻底，是真正的恢复。
对比了漩涡一族的忍者，对比了千手一族，对比了很多血脉家族的忍者血脉，羽田宁身上发生的事情，真的是太过于特别了。
在羽田宁城和北川美纱，这对夫妇的身上，也是不能寻找到任何的蛛丝马迹，羽田宁的身份就变得有些扑朔迷离。
他要进行一场训练，而训练的目的的便是木叶的死亡森林之中，这里野兽迅猛，是曾经的古战场，如今森林重新出现在这片森林之上。
羽田宁其实一直都在搜寻一个人尸体，也就是传说中的初代火影，如今鸣人还没有诞生的时代里，他想要从初代的身上找寻关于六道仙人儿子的气息。
毕竟即便是他已经死了，那种灵魂印记也不会消失掉，而他想要继续变强的话，找寻到这位初代大人也说不定能让自己提升不少。
只是初代的死亡就像是一个秘密一般，在任何地方都没有相关的记录，阴差阳错之下，他找到了另外的一具尸体，二代火影千手扉间的尸体。只是有些为难的是，这个人他现在不敢召唤出来，秽土转生便是这个人研究出来的术，他将二代转生出来的话，那势必会面临失控的画面。当然以他现在的实力，也是绝对能够将秽土转生的二代给控制住的，但毕竟这不是绝对，他不觉得自己真的能掌控这位二代大人。
接触的东西多了之后，他才真正的明白这位二代的强大，二代火影不仅仅是一个忍者，他更是一个极其聪颖之人，光是忍术他就开发出来太多了。
时间过的非常的快，三战开启，和神组织的对战，也已经到了白热化的阶段。
当然这段时间发生了太多的事情，但对于羽田宁来说，他都不大关注这些问题，他现在只是想要提升自己的实力，让自己变得真正强大起来，以后真正的面对那个强大的神组织。
两年的时间，也就是羽田宁到了十八岁的时候，终于还是迎接来了火影大人的催促，让他尽快出山。
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